هدفت هذه الدراسة إلى بيان فاعلية الرقابة المالية لنظم المعلومات المحاسبية الالكترونية في المؤسسات الحكومية، إذ أظهرت نتائج ‏الدراسة وجود أثر ذو دلالة إحصائية عند‎ ‎مستوى‎ ‎دلالة‎ ‎معنوية (0.05) لاستخدام نظم المعلومات الحاسوبية في مرحلة التخطيط ‏في تحسين فاعلية التدقيق الداخلي في وزارة المالية والهيئات التابعة لها في العراق- بغداد، ووجود أثر ذو دلالة إحصائية عند‎ ‎مستوى‎ ‎دلالة‎ ‎معنوية (0.05) لاستخدام نظم المعلومات الحاسوبية في مرحلة التحقق من الأرصدة والإجماليات، وعملية التدقيق ‏وإصدار تقرير المدقق في تحسين فاعلية التدقيق الداخلي في وزارة المالية والهيئات التابعة لها في العراق، ووجود أثر ذو دلالة ‏إحصائية عند‎ ‎مستوى‎ ‎دلالة‎ ‎معنوية (0.05) لاستخدام نظم المعلومات الحاسوبية في موثوقية ومصداقية القوائم المالية في وزارة ‏المالية والهيئات التابعة لها في العراق، وأخيراً أوصت بضرورة التحسين المستمر لنظم المعلومات المحاسبية في المؤسسات العراقية ‏مما سيمكنها من مواكبة التطورات التكنولوجية في المجال المالي والمحاسبي وينعكس إيجاباً على الرقابة الداخلية.‏