هدفت هذه الدراسة إلى بيان أثر نظم المعلومات المحاسبية في الرقابة الداخلية في المؤسسات الحكومية، إذ أظهرت نتائج الدراسة ‏وجود مستوى مرتفع من التقدير لمحور مدى تحسين نظم المعلومات الحاسوبية فاعلية التدقيق الداخلي في وزارة المالية والهيئات ‏التابعة لها في العراق‎ ‎‏-‏‎ ‎بغداد، كما أظهرت الدراسة وجود دور نظم المعلومات المحاسبية في تحقيق رقابة داخلية فاعلة في ‏المؤسسات العراقية، وجود أثر ذو دلالة إحصائية عند‎ ‎مستوى‎ ‎دلالة‎ ‎معنوية (0.05) لاستخدام نظم المعلومات الحاسوبية في ‏مرحلة التخطيط في تحسين فاعلية التدقيق الداخلي في وزارة المالية والهيئات التابعة لها في العراق - بغداد، ووجود أثر ذو دلالة ‏إحصائية عند‎ ‎مستوى‎ ‎دلالة‎ ‎معنوية (0.05) لاستخدام نظم المعلومات الحاسوبية في مرحلة التحقق من الأرصدة والإجماليات ، ‏وعملية التدقيق وإصدار تقرير المدقق في تحسين فاعلية التدقيق الداخلي في وزارة المالية والهيئات التابعة لها في العراق‎ ‎‏-‏‎ ‎بغداد، ‏كما أظهرت وجود أثر ذو دلالة إحصائية عند‎ ‎مستوى‎ ‎دلالة‎ ‎معنوية (0.05) لاستخدام نظم المعلومات الحاسوبية في موثوقية ‏ومصداقية القوائم المالية في وزارة المالية والهيئات التابعة لها في العراق‎ ‎‏-‏‎ ‎بغداد، وأخيراً أوصت بضرورة التحسين المستمر لنظم ‏المعلومات المحاسبية في المؤسسات العراقية مما سيمكنها من مواكبة التطورات التكنولوجية في المجال المالي والمحاسبي وينعكس ‏إيجاباً على الرقابة الداخلية.‏